乔振飞在皇帝段浩然的支持下，几乎把当时新军名将和主力全用上了，在东南沿海层层布防：段长庆率领庆字营三千人驻守东山；段盛波、段盛传率领盛字营五千人驻守直隶；段秉璋率领“良军”三千人驻守江浙；段树声率领“树军”五千人坐镇东广、西广，转运枪械资粮；段铭传调任大福巡抚，率领旧部将领段定奎的六千五百名铭军驰防台岛；长江口的吴淞口和江阴炮台，由新军装备最先进的开花炮队驻守。
这一严密的全盘布局，充分体现出乔振飞是知人善用的新军领袖，指挥“帅才”的帅才，其卓越的军事指挥才能和“定海神针”的巨大能量，还真找不出第二个人。
高卢国的孤拔在马尾击溃段佩纶的大福水师后，带着舰队到东南沿海游弋，拿着军用望远镜瞪大蓝眼珠，找了半天，也找不出乔振飞丝毫的布防漏洞。他急红了眼，也没细打听台岛是谁在驻守，凭感觉认为台岛没开发，比较贫穷落后，应该很好占领，便带着远东舰队直奔隆基。
乔振飞率领两千新军入台后，立即发现黄龙军的布防重南轻北。台南有台岛道台刘璈置的重兵三十营，而台北方向，只有曹志忠六个营、孙开华三个营和段铭传带来的一百三十多个亲兵。乔振飞知道高卢军的主攻方向一定是台北方向的隆基和淡水，于是向刘璈的营地调兵。
刘璈是湖南岳阳人，颇有战功，后来没受重用跳槽到新军，当了台岛道台多年，在当地颇有势力，但这人一向狂傲自负，觉得乔振飞年纪轻轻，胡说八道，高卢国人去台北那些不毛之地干什么？硬是搪塞着不给调兵。
乔振飞大怒，当机立断，去淡水找大哥段铭传。他们一商议，摆了一桌“鸿门宴”，将刘璈拿下，以贻误战机为名把他绑了，要捕他入狱。刘璈狡辩说：“我奉令驻守台南，没有朝廷的旨意，万不可随意调兵”，他带来的上千营兵这时也全冲了进来，双方剑拔弩张！
眼看局势就要逆天，段铭传刷地站起身来，掀翻了桌子，拔出佩刀，一刀砍断了方桌的一条腿，虎目一瞪，大声呵道：“将在外，君命有所不受。我现在是大福巡抚，统领台岛防务，胆敢违我令者，斩！”
刘六麻子的大名在新军中早就如雷贯耳，看他如此坚决，刘璈的亲兵赶紧把刀子哐当哐当扔到地上，转投段铭传了。于是，段铭传火速派亲兵接管了刘璈的全部营兵，全台震动，段铭传的威信也一下子树立了起来。
乔振飞和段铭传商量，由他的新军驻守台岛东北方向的隆基港口，段铭传驻守台岛西北方向的淡水港口，也就是沪尾。搞海战黄龙军没有铁甲军舰，所以两人一致认为，应该扬长避短，进行陆战，先让高卢国人登陆，然后围而歼灭。
果然，孤拔认为，台南从同治年间就有新军驻扎，不容易突破，于是声东击西，从台北突破。只派了两艘军舰去台南做幌子，自己带着高卢军主力奔袭隆基。
孤拔的常胜军刚打了大胜仗，见识了张佩纶的“疑军计”，门牙都笑掉了，以为黄龙军将领都是张佩纶，所以骄傲轻敌。孤拔的先锋官、高卢国海军利士比率领四艘军舰先抵达隆基港，派了一名传令官上岸，给乔振飞送了一份劝降书，大意是“顺我者昌逆我者亡”。
乔振飞送了利士比一只绿毛海龟，让传令官给他带回去。利士比一看这只缩头绿龟，不解其意，问身边的黄龙国翻译马世阁：“这龟是什么意思？”
马世阁了解黄龙国国情，聪明绝顶，说：“恭喜大人，龟即是归也。这黄龙军将领要投降，但又不好明说。”
利士比大喜，但他觉得要先兵后礼，给黄龙军一点颜色瞧瞧先，于是指挥法舰炮轰隆基炮台，很快把炮台摧毁，然后带着八十名海军陆战队员，趾高气昂上岸接受黄龙军的“降归”了。
登陆很顺畅，利士比带着八十名牛高马大的高卢兵隆基抢滩，基本没遇到抵抗。他傻得可爱，命令急行军，跑步到乔振飞驻扎的山头收降。
那山头距离隆基港大概十里地，已经在军舰火炮的射程之外。乔振飞在山头上很淡定地数着利士比带来的高卢军，一、二、三……靠，才八十人，也别浪费加农炮和克虏伯炮了，直接命令埋伏在山谷里的兄弟拿德国新采购的毛瑟枪开火。
这毛瑟枪还真好使，弹仓内装8发枪弹，可以连续击打，枪托受力均匀，用起来一点都不伤手。三面夹击，八十个高卢军赶紧把军装的衣领高高竖起，把头缩进去。因为当时高卢军陆战队的军服是绿的，黄龙军一边打，一边还高喊：“缩头乌龟”，这时利士比才明白乔振飞送他绿毛海龟是什么意思。他命大，在法兵重火力的掩护下，一个人狼狈逃回了舰上，马上把翻译马世阁扔到海里喂鲨鱼了。
隆基初战告捷，虽然才打死打伤七八十个高卢国侵略者，但是打破了孤拔常胜军不可战胜的神话，极大鼓舞了守台黄龙军的士气，意义不亚于历史上对日军的平型关大捷。
利士比败退后，回报孤拔说乔振飞带领的新军武器如何先进，连德国佬的毛瑟枪都有，孤拔气得一巴掌把利士比的军帽打飞了：“你滚去淡水打段铭传，我来对付隆基的支那人。”于是，高卢军兵分两路，孤拔率领“凯旋号”等七艘军舰和两艘鱼雷艇进攻隆基，利士比率领“拉加利桑尼亚”号等三艘军舰进攻沪尾，也就是淡水。
在隆基取得首场胜利后的乔振飞并没有头脑发热，他料到孤拔肯定会亲率舰队来攻打隆基。因为当时的军舰是蒸汽船，要烧煤的，孤拔的舰队在东南沿海游弋消耗了太多的煤，必须来隆基补充，接下来隆基肯定会有一场更加惨烈的战斗。
乔振飞知道孤拔一心要攻占煤矿，补给战舰。他在朝鲜练新式新军时间不长，而且翁同龢掌管的户部银子卡得很紧，他也就托李凤苞在德国采购了一百支毛瑟枪和五门克虏伯炮，加上上次在北山缴获的四门加农炮，一共也就九门新式火炮。而孤拔的两千高卢军来复枪就有五百多条，还有四十多门加农炮，胜败未卜！
以防万一，乔振飞先下令将隆基煤矿的机械全部拆毁、矿坑里全部灌满水，一万多吨存煤全部点燃，在煤矿一片熊熊的烈火中，乔振飞率领新军和孤拔登陆的高卢军，展开了一场激烈的生死战。
孤拔率领一千五百名高卢军从隆基登陆，乔振飞远远从望远镜里看到高卢军的火枪和火炮，就知道这是一支训练有素的虎狼之师。他心里很清楚，打高卢军必须持久战，要引诱高卢军上岸，让高卢军远离铁甲军舰上的舰炮支援。
需要正面迎战双倍于自己的高卢军，这一仗注定不轻松，乔振飞详细察看隆基的地形，决定选择两个地方和高卢军决战，一个是隆基港不远的狮球岭，另一个是隆基的煤矿厂。
乔振飞派曹志忠、章高元带了八百新军坚守狮球岭。孤拔登陆后，先命令一队燧发枪兵密集开火，再派一队高卢掷弹步兵投炸弹，狮球岭上顿时浓烟滚滚，山头被炸平了好几米，然后，孤拔命令高卢军的来复枪兵形成散兵线，强攻山头。
曹志忠、章高元马上组织火力反击，浴血奋战，他们激战四小时，打死孤拔三百多法兵，自身伤亡一百多人。
孤拔一看正面强攻有难度，便命令高卢军改从两侧山头迂回攻击，新军三面受敌。
章高元带人退守山口，顽强搏战，战事处于胶着状态，双方各有伤亡，但形势渐渐不利新军。曹志忠派陈昱跑到煤矿场，跪下来哭谏乔振飞派援军，乔振飞摇头拒绝，将自己的一支黑色毛瑟枪解下，送给了陈昱：“你去拜托狮球岭的兄弟们，就算战斗到最后一个人，战斗到最后一颗子弹，也要再坚持一个时辰！到时候，我会用孤拔的人头，来祭奠兄弟们的在天英灵！”
陈昱抹干眼泪，接过毛瑟枪，头也不回重回战场，乔振飞望着他远去的背影，眼眶湿润了，他也知道曹志忠他们这些新军兄弟在狮球岭打得惨烈，但自己已没多余的兵可派。本来还有六百新军，乔振飞已派他们趁夜色去偷袭高卢国舰队，新军的重炮，也交给他们了。
当“砰砰砰”的枪声在隆基煤场响起，血色的晚霞，染透了半边海天。乔振飞带着六百新军，把脸都用煤灰抹成黑色，在煤山上以逸待劳。孤拔的军队近了，乔振飞的眼睛，也被旁边的烈火烧红，他指挥新军开始绝地反击，先是炮战，然后枪战，后来乔振飞还命令居高临下的新军朝攻来的高卢军投掷带火的煤块，很多高卢军的军装被点燃，烧得鬼哭狼嚎，手舞足蹈解军装上的铜扣子，大火借着风势蔓延，很多高卢军被活活烧死，烧红了整个隆基的天空。
那一夜，煤矿场的争夺战打得相当惨烈。孤拔的高卢军三次占领煤场，乔振飞三次指挥新军夺回，孤拔不断把军舰上的高卢军派来支援。最后，乔振飞不得不坐在一堆法兵的尸体旁喘气，感受着战争的残酷。
在煤矿山的战斗持续了一整夜，双方伤亡惨重，孤拔损军六百多，乔振飞的新军也牺牲二百多，但由于乔振飞吸引并牵制了高卢军的主力，装扮成渔民去偷袭高卢军舰队的六百新军，伤亡十来个，就炸沉高卢国铁甲军舰四艘，鱼雷艇两艘，高卢军伤亡二百多。
孤拔听到后方的军舰被偷袭，赶紧带高卢军回援，乔振飞趁胜追击，曹志忠、章高元溃退到深山老林里的新军也趁机出来反攻，和乔振飞一起前后夹击孤拔的高卢军。孤拔的高卢军最后损失一千多人，只带着三艘铁甲军舰和不足五百高卢军狼狈而逃。
与此同时，高卢国海军利士比率领三艘军舰浩浩荡荡开去淡水港战段铭传，他根本不知道，这是在找死。
接到淡水前敌营官李彤恩敌舰来犯的急报，段铭传亲自骑马到海边一看，红日初升，金光耀眼，海上还升起白色浓雾，伸手不见五指，他大喜，仰天长啸：“真是天助我也！”
段铭传当即命令新军的炮队集结，利用军舰在炫目的太阳光下无法瞄准海岸目标，而黄龙军炮台又被晨雾笼罩的有利时机，马上开火，抢先向三艘军舰发起炮击。
利士比阵脚大乱，命令军舰的火力全开反击，双方激战三小时，高卢国的重炮威力过猛，特别是高卢国哈乞开斯公司制造的哈乞开斯速射炮，每分钟开火六十发，淡水港当即被轰隆隆的炮弹掀起巨浪，炮台上的黄龙军衣服湿透了，火力渐渐被压制了下去，段铭传最后决定还是让高卢军先登陆，然后再收拾他们。
利士比在炮战中得胜后，带着六百名高卢国士兵上岸，段铭传假装溃逃，利士比指挥着嗷嗷叫的高卢兵，迅猛追击，转眼间，就钻进一片茂密的丛林。即便是大白天，四周林荫蔽日，黑乎乎的，利士比有点害怕了，让高卢军停止追击。这时，当地民团土勇从四周埋伏的草丛中冲了出来，嗖嗖的箭声、枪声和喊杀声把利士比下破了胆，他赶紧调转马头，一路呼喊着“上帝”往军舰上狂奔。
但已经晚了，段铭传已经抽出战刀，指挥着新军开枪反击，高卢国兵高大的身躯成了移动的靶子，死伤惨重。段铭传带着新军奋勇追击逃跑的高卢军，砍杀高卢国侵略者三百多人，利士比本人被段铭传一刀砍掉左胳膊，黄龙军取得了震惊中外的“淡水大捷”。