傍晚,他被接二连三的电话吵醒。三家测序公司全都散发着大号拖延症的气质,像是约好了一样,在承诺时效的前一天晚上才和他沟通。
沟通的内容无非就是怀疑样本被污染了,所以提前声明不对测序结果的解读负责。
卢赫见怪不怪地一顿“嗯嗯啊啊好好好”迅速把他们都给打发了,随后邮箱被测序报告塞满。
他从床上爬起来,穿戴整齐,甚至用梳子蘸水梳了头发。
随后他郑重地走下楼,走进细胞间,一屁股坐在电脑前,伸手去手捞椅背,把正在忙碌的菜菜一把拽了过来。
“歇会儿歇会儿,陪我吃瓜。”
这次他们率先打开了基因组原始数据。基准30亿个碱基对,有效分析了30亿个碱基对。gc含量57%。
怎么还是这么高?
两人的脑袋凑在一起,紧盯着屏幕上缓缓滑过的密密麻麻的字符。这次依然是满屏的红和绿,但红多绿少。
“停!”菜菜指着刚掠过的一段字符惊呼,“你看这段,ggagtt,这不是终止子吗?”
卢赫定睛一看,“是啊,这是转录终止修饰点,而且是依赖rho因子依赖rho因子的的转录终止:rho因子是一种大分子蛋白,可结合在新生的rna链上,借助水解atp获得能量推动自身沿着rna链移动,但移动速度比rna聚合酶慢。当rna聚合酶遇到终止子时便发生暂停,rho因子得以赶上酶。rho因子与rna聚合酶相互作用,使rna、rna聚合酶与自身一起从dna上释放下来,以防占着茅坑不拉屎。
[2]gc区:控制转录起始的频率,基本不参与转录起始位点的确定。
[3]tata区:确定转录起始位点,使转录能够精准地开始与结束。